两所大学各有优势，如果计划未来在川渝地区发展，那么选重庆大学更合适，因为吉林大学在川渝地区的影响力很显然是无法与重庆大学相比的。此外，重庆大学强基计划相较于吉林大学的突出优势在于融入了工科优势学科资源进行交叉培养，培养目标也比较贴和国家高端战略人才需求。
如果对于就业地域兀局限于川渝地区，那么选择吉林大学相对来说更具性价比，首先吉林大学的数学、物理学、化学都是国家指定的一流建设学科，其次吉林大学的强基计划理学学科部分是直接从“唐敖庆班”的招生计划里拿出来的，唐敖庆班可以说是集中了吉林大学理学学科最优质的资源。
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